Sağlıklı şekilde yerinde yapılan temizleme yani sektörde bilinen adı ile “CIP” üretim prosesinin en önemli unsurudur. Düzgün yapılan CIP, ürün kalitesini doğrudan etkiler. Kontaminasyon problemlerini en aza indirir ve kullanılan ekipmanların ömürlerini uzatır. En önemlisi sağlık ve bakteri oluşumu açısından üretimden önce ve üretimden sonra CIP yapılması gerekmektedir. CIP Sistemleri, makinelerin boru hatlarını, erişilemeyen bölgelerini, ekipmanları söküp çıkarmadan su ve deterjanlar yardımı ile doğrudan temizliğini sağlamaktadır. Doğrudan tanklardan yapılan sirkülasyon ile, boru hatları, eşanjörler, vanalar, pompalar gibi proses ekipmanları bir sonraki üretim için hijyenik ve hazır duruma gelir.